Woda demineralizowana ma szerokie zastosowanie w laboratoriach; między innymi używana jest do: 

• przechowywania odczynników chemicznych,

• rozcieńczania roztworów,

• mycia szkła i sprzętu laboratoryjnego

• spektroskopia i chromatografia

• hodowla komórek i mikroorganizmów - do przygotowywania pożywek

• w autoklawach do sterylizacji.